中文

English

尊龙凯时无培养的全亚型和耐药基因靶向NGS方案

发布时间:2025-02-23   信息来源:尊龙凯时官方编辑

结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)是一个全球范围内的重要致病菌,导致的结核病是一种致死率极高的疾病。其标准株H37Rv于1998年完成测序,基因组大小约为44MB,包含超过3900个蛋白编码基因。当前,结核分枝杆菌可分为7个主要谱系,已知的耐药基因包括embB、rpoB、gyrA等。

尊龙凯时无培养的全亚型和耐药基因靶向NGS方案

在2023年10月17日,世界卫生组织(WHO)在其官网发布了《应用新一代测序检测技术开展耐药结核病监测的实施性手册》。WHO指出,新一代测序(NGS)能够提供全面的耐药谱系检测,减少对表型药敏检测的需求,这对于表型药敏检测不可靠的药物尤其重要。NGS技术将为结核病的治疗方案制定提供更为全面的耐药谱检测,进而提高化疗方案的精准性。

然而,由于结核杆菌的基因组较大,目前许多靶向结核NGS方法(tNGS)无法全面覆盖所有亚型和耐药基因。虽然全基因组测序(WGS)能够涵盖整个基因组,但需要培养物以确保检测的可靠性。为了解决这一问题,尊龙凯时推出了QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel,该试剂盒无须培养,能够直接实现结核全基因组靶向建库,并覆盖7种主要谱系亚型及所有已知耐药基因。

QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel基于杂交捕获技术,支持痰液、脑脊液、粪便等样本的结核全基因组测序,仅需10ng起始DNA,无需提前培养。其高特异性和灵敏度的捕获探针可在低拷贝样本中实现基因组的高覆盖,即使是难以覆盖的PE/PPE基因区域也能实现均匀的高深度覆盖,从而有效地完成结核病的分型。

获取结核病的全基因组数据后,您可以使用CLC Genomics Workbench的结核分枝杆菌分析工具,轻松完成质量控制、序列比对、谱系鉴定和耐药变异等分析。同时,还可以进行变异注释与比较、变异对蛋白结构影响的评估、cgMLST分型、最小生成树和SNP tree构建等分析。

除了QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel,尊龙凯时还同步推出了QIAseq x HYB Hep C Panel,专用于丙肝病毒全基因组靶向测序,该产品同样覆盖了丙肝病毒的所有亚型,并与CLC Genomics Workbench生物信息分析系统无缝对接,以便一键获取分析结果。未来,尊龙凯时还计划推出针对客户目标微生物的定制化靶向Panel,敬请期待!如欲了解更多信息,欢迎扫描下方二维码与我们联系。