第三章:实时荧光定量PCR的应用
一、相对定量
在不同样品中测定基因表达量的相对值时,内参基因的选择显得尤为重要。选择内参基因时需遵循以下原则:
(1)始终选择表达丰度高且稳定的基因作为内参基因;
(2)避免盲目选择常用的内参基因;
(3)常见的内参基因包括GAPDH、Actin和Tubulin。
内参基因的正确选择直接影响结果的有效性。在加入内参基因后,可以进行结果的计算。
二、绝对定量
通过标准品,可以测定样品中基因表达量的绝对值(拷贝数)。标准品可以是:
A:具有明确拷贝数的克隆质粒;
B:PCR产物;
C:cDNA(请注意,尽管cDNA可以用于扩增效率测定,其在绝对定量中使用效果有限)。
拷贝数的计算则需要根据平均分子量(MW)进行。具体计算方法如下:
dsDNA = (碱基数) × (660道尔顿/碱基);
ssDNA = (碱基数) × (330道尔顿/碱基);
ssRNA = (碱基数) × (340道尔顿/碱基)。
拷贝数计算公式为:
(6.022 × 10²³ 拷贝数/摩尔) × (浓度 g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml。
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